在龟冬眠期间，如果养殖管理不仔细，很容易使龟死亡。对于生活在较冷地区的龟来说，最理想的冬眠温度应为7℃～10℃，如果长时间让龟处于过低温度的环境中会造成龟的死亡。龟保持冬眠状态的最佳时间是3～4个月，处于野生环境中的龟保持冬眠状态的时间一般会更长一些，但在人工养殖条件下，适当缩短冬眠的时间不会对它们的健康产生不利影响。
每月最多可查看1次龟的冬眠情况，除非在非常特殊的情况下，养殖者才能去打扰一只正在冬眠的龟。打扰的次数过多，很有可能会提高冬眠龟的死亡率。
养殖者选择好龟冬眠用的容器后，不能简单地将它们直接放置于外界的温度下，并且直到龟结束冬眠状态。任何种类的冬眠龟，长时间处于3℃以下的环境中，都会有极高的死亡率。在让龟冬眠前，还应保证龟的体内完全是“空的”，以免因温度下降造成直肠梗塞。方法：在龟冬眠前1周，每天让龟洗30分钟的温水澡，这是让龟肠胃系统“清洁”的关键。注意分清所养的龟是否有冬眠习惯。若不分青红皂自地让那些本来没有冬眠习惯的龟冬眠，也会造成龟的死亡。
龟冬眠后应注意的问题：当冬眠期即将结束的时候，养殖者便可去“唤醒”正在冬眠的龟了。但不能简单地将冬眠的龟移至温暖的地方了事，这样会造成龟的猝死或引发其他疾病。所以，应该将冬眠龟所处的环境温度逐步升高，让其有一个慢慢适应的过程。这个过程应该持续1周左右。
刚从冬眠中醒来的龟对食物没有兴趣，拒绝摄食，养殖者要先投喂少而精的饲料，并在饲料中拌入适量营养药物和抗生素，逐步加大饲料投喂量，一段时间后，再按龟的最大食量投喂饲料，使龟的体质尽快恢复。
龟在冬眠过程中体内新陈代谢减慢，消化停止，循环减慢，免疫和其他自我保护功能减弱或停止，疾病会趁虚而入，建议养龟者不能让病龟或虚弱的龟冬眠。对于刚孵化出来的龟，最好在头两年里不要让它们冬眠。对于不能冬眠的稚龟，可以在冬季降温时进行加温养殖，如果养的是陆龟，可以用普通台灯配上普通白炽灯泡或爬行动物专用灯泡（含紫外线）、爬行动物专用电热毯、加热石，或者在房间里放上电暖气加温。但要注意不要让空气太干燥。如果养的是水龟，可以在水里放上恒温棒，使其安全过冬。
